Les dix premières pages du prologue du volume 1 sont consacrées à Kiritsugu et sa vision de "défenseur de la justice". Kiritsugu, tueur à gages, le mage freelance surnommé "tueur de mage", a pour objectif de sauver des vies : le prologue du volume 1 démontre donc que dans ce but, il s'est entraîné à tuer. Il se doit d'être la balance qui va décider de qui il doit tuer et de qui mérite d'être sauvé de ces meurtres. Tuer une centaines d'ennemis, et peut-être quelques innocents, en vaut amplement la peine si cela peut sauver des milliers d'innocents qui ne méritent pas de mourir. Mais il lui faut pour cela être absolument impartial, objectif. La naissance de sa fille est la pire chose qu'il puisse lui arriver.
Kiritsugu dispose d'une capacité particulière, Innate Time Control : il peut accélérer ou ralentir le temps de façon localisée, principalement sur lui-même ou sur des volumes restreints. Cette capacité se rapproche très fortement d'un Reality Marble, mais n'en est apparemment pas totalement un.
Sa méthode de prédilection est le combat à l'arme à feu : son arme principale est un Thompson Contender, modifié pour ses balles spéciales : il s'agit d'un Mystic Code, une arme servant à amplifier les sorts ou bien capable de réaliser un mystère particulier ; de nombreux mages en possèdent au moins un. Ainsi, les balles qu'il utilise contiennent de la poudre de ses propres os, et sont enchantées pour forcer son emprunte magiciensque dans sa cible : si c'est un mage, cela provoque de graves dégâts (on pourrait presque la qualifier d'une imitation d'arme conceptuelle). Kiritsugu manie également un semi-automatique Calico 960 et un fusil sniper Walther WA 2000. Pour lui, attirer l'attention avec Saber et Irisviel est un excellent moyen de tendre des pièges et d'abattre ses adversaires de loin. Kiritsugu pense que la technologie est devenu un point faible des magiciens, et, ayant découvert que la température du corps variait lors de l'utilisation des circuits magiques, il se sert de viseur à détection infrarouge pour identifier un mage ennemi ; il installe aussi des caméras sur les chauves-souris de reconnaissance de Maiya, une caméra n'étant pas affectée par une barrière magique de désorientation ou autre.
Il peut aller jusqu'à prendre des otages et faire sauter des hôtels entiers pour atteindre sa cible. Ces méthodes, bien évidemment, sont déployées dans le but d'éliminer ceux qui représentent un danger pour la sauvegarde des innocents. Se servir d'un fusil sniper sur un Maître reste effectivement la méthode la plus radicale pour empêcher une marée de monstres de raser la ville, après tout. Il est cependant impitoyable, et peut paraître plus cruel que nécessaire si son objectif est atteint.

Femme de Kiritsugu, Irisviel est un homoncule de la famille Einsbern ; pour la quatrième Guerre, elle possède en elle le conteneur du Graal. Créée dans le seul but de devenir le Graal, sans aucun besoin pour un quelconque bonheur, elle le trouve quand même en tombant amoureuse de Kiritsugu ainsi que de son idéal. Elle est sans doute la seule à comprendre qui il est vraiment : elle sait par exemple que, si Kiritsugu refuse de parler à Saber sitôt qu'il apprend qu'elle est une femme, ce n'est pas par misogynie, mais par colère envers ceux qui ont forcé une jeune fille prendre un tel fardeau, et envers Saber pour l'avoir accepté si facilement ; elle sait aussi que s'il l'ignore délibérément, c'est parce qu'il ne saurait pas quoi lui dire. Elle comprend le point de vue de Kiritsugu comme celui de Saber et leur opposition, mais ne peut pas les empêcher de diverger, et s'en trouve bien désolée.
Irisviel est sincère, souvent énergique, et surtout pleine d'innocence. Élevée dans le château des Einsbern, elle ne connaît pas grand-chose de la société par elle-même. C'est elle qui s'amusera à choisir les vêtements de jour de Saber.

Élève brillant au Big Ben, il s'est évertué à démontrer que la lignée n'était pas forcément plus importante que le travail et le talent réel pour un mage. Pourtant, son ouvrage représentant trois ans de recherche et de rédaction est réduit en pièces par son enseignant, Lord Kayneth Archibald El-Melloi. En guise de vengeance, Waver lui a volé l'artefact dont il devait se servir pour invoquer un Servant. Waver s'en est servi à sa place, et intègre ainsi la quatrième Guerre du Graal en contrôlant Rider (ou pas...). Il se fait passer pour le petit-fils de Glenn et Martha McKenzie pour se loger en parasite.
S'il est talentueux, il est aussi très fier, voir arrogant, pas très honnête et assez colérique, surtout lorsqu'il se trouve impuissant. L'attitude désinvolte de Rider a tout pour l'enrager. Il lui faut pourtant apprendre à être un mage mature s'il veut avoir une chance de survie.
À la suite de Fate/Zero, il deviendra Lord El-Melloi II suite aux pressions de la sœur de Kayneth, dernière représentante de la lignée des Archibald. Waver étant le premier responsable de la mort de Kayneth, la sœur de celui-ci force Waver à reprendre le nom pour restaurer leur maison. Waver deviendra plus tard un grand professeur de l'Association, et sera un enseignant de Rin lorsqu'elle y ira. Il aura un talent certain pour dénicher les meilleurs potentiels et les développer grandement, mais n'aime en réalité pas s'occuper des autres. Petit lors de Fate/Zero, il se trouvera assez grandi 10 ans plus tard, et sera surnommé "professeur Charisme", le premier avec qui les étudiantes du Big Ben aimeraient coucher.

Le roi des Conquérants. Rider possède une carrure massive, semblable à un ours, ainsi que de courts cheveux et barbe de feu. Insouciant, voir sans gène, il veut immédiatement revenir en Macédoine, conquérant les pays qu'il traverse, pour annoncer son retour triomphal. Gagner le Graal avant ? Une formalité, un détail ! Il souhaite également acheter une dizaine de B2 et considère son prochain rival comme étant Bill Clinton, plus dangereux que Darius... Il interrompra audacieusement un combat entre Lancer, Saber et Berserker, veillant à ce que chacun s'en aille en vie. Commandant un t-shirt par Internet, il veut absolument sortir en le portant, sans réaliser qu'il lui faut aussi un pantalon. Il fait donc jurer à Waver que sitôt qu'il lui rapportera la tête d'un Servant ennemi, Waver lui achètera un pantalon pour qu'il puisse porter le tout dehors ! De toute évidence, Rider n'en fait vraiment qu'à sa tête...
Il possède pour l'instant comme Noble Phantasm la Roue de Gordius (Via Expugnatio), un chariot tiré par des taureaux divins capable de voler et de déclencher des éclairs. Waver évalue sa puissance à un bombardier, capable de raser une ville en moins d'une heure ; il peut également rivaliser avec les attaques à pleine puissance de Saber et Berserker.
Un second Noble Phantasm terrifiant se nomme Aionioi Etairoi, un type original de Reality Marble. Si d'habitude un Reality Marble reflète la nature réelle de l'utilisateur, celui-ci est son monde ainsi que de tous ses guerriers en même temps, Bucéphale inclus ; c'est un Reality Marble partagé, représentatif de l'armée du conquérant et de leur volonté de répondre à l'appel du roi. Tous ses guerriers ont chacun le niveau d'un Servant ! Serait-ce le Noble Phantasm auquel il était fait allusion lorsqu'il était dit qu'Alexandre le Grand possédait un Noble Phantasm capable de rivaliser avec celui de Gilgamesh ?

Tokiomi, père de Rin et Sakura, est un mage arrogant et peut-être cruel. Il a volontairement accédé à la demande de Zouken et lui a donné Sakura, vraisemblablement en étant au courant de ce qu'il pourrait arriver. En effet, un mage ne peut transmettre son héritage et ses compétences qu'à un seul enfant : un deuxième ne sert donc à rien, n'est-ce pas ? Tokiomi attache une grande importance à la noblesse, et fait preuve de respect excessif envers Archer, reconnaissant sa dignité, sa royauté, sa divinité ; il déplore par contre son incontrôlabilité. Y a-t-il quelque chose derrière l'arrogance de Tokiomi ?

Le roi des Héros. Il est le même que dans Fate/Stay Night, mais apparaît ici bien plus sérieux, donc nettement plus dangereux ; il n'est pas encore tombé amoureux de Saber non plus. Il est particulièrement irrité par la présence des "trois rois" (Saber, Rider et lui-même). Pour l'instant, il sait que ce monde ne vaut pas grand-chose mais le trouve malgré tout digne de son intérêt : avant que les combats ne commencent, il n'avait pas passé une seule nuit entière sans se promener dans la ville pour observer les gens. En revanche, son appréciation de Tokiomi va en se dégradant...
Bien sûr, ses Noble Phantasms sont encore les mêmes que dans Fate/Stay Night ; on voit surtout Gate of Babylon, qui nous révèle cette fois une machine volante. Ea n'a pas encore fait son apparition à l'heure du tome 3.

Kirei est l'un de ceux que Kiritsugu identifie comme la menace principale, un homme dangereux. Il n'a jamais su donner de sens à son existence, trouver le moindre intérêt en quoi que ce soit. Kirei, face à lui-même, s'est torturé, entraîné, et s'est retrouvé proche de l'élite des exécuteurs avant même de s'en apercevoir. Sa femme avait tenté de le changer, de lui montrer qu'il pouvait aimer, mais est morte trois ans avant le début de la Guerre, quelques jours avant que Kirei ne rencontre Tokiomi, après deux ans de mariage. Même à sa mort, Kirei n'a pas su quoi ressentir. A-t-il pleuré sa mort par amour ou parce qu'il aurait voulu la tuer lui-même ? Le suicide n'est pas une solution car il ne supporterait pas qu'une chose si triviale le change alors que même sa femme n'y était pas parvenue. La Guerre permettra-t-elle à Kirei de se donner un sens ?
Kirei, comme son père Risei, est membre de l'Assemblée du Huitième Sacre, un groupe haut placé dans la hiérarchie de l'Église. Il est aussi un Exécuteur ; pour comparaison, Ciel de Tsukihime est également un Exécuteur, mais fait partie des sept membres (et demi) de l'agence des Fossoyeurs, l'élite de l'Assemblée. Lorsque les reiju apparaissent sur sa main, il demande conseil à son père, qui reconnaît automatiquement les marques et le mène à Tohsaka Tokiomi. La famille Tohsaka étant d'anciens chrétiens liés à l'Église, Risei s'arrange pour que Kirei soit officiellement transféré de l'Église vers l'association des Magiciens, et devienne un mage sous la tutelle de Tokiomi. C'est ce qu'il fera pendant trois ans chez la famille Tohsaka jusqu'au début de la quatrième Guerre. Rin ne l'aime pas du tout, d'abord pour lui avoir volé sa place auprès de son père qu'elle respecte énormément en tant que mage, ensuite pour l'homme qu'il est.

Comme tous les Assassins, celui invoqué par Kirei est un des 18 Hassan i Sabbah de la secte des Hashshashin. Comme les autres Assassins, son Noble Phantasm est nommé Zabaniya, et le sien en particulier est Delusional Illusion : il a un très grand nombre de personnalités, qui peuvent chacune avoir un corps et agir indépendamment. Si cela lui donne un énorme éventail de compétences et lui permet d'être à plusieurs endroits en même temps, les statistiques de chaque personnalité sont divisées entre chacune. Ce n'est donc pas réellement comparable à une petite armée. Cela les rend très faibles, et leur utilité principale est donc l'espionnage et l'infiltration en général, selon les spécificités de chacune des personnalités.

Risei est un prêtre membre des Exécuteurs de l'Église comme son fils. Ancien ami de la famille Tohsaka, il sait qu'il doit prévenir Tokiomi dès l'apparition des reiju sur la main de Kirei. Risei est le superviseur de la Guerre, mais les liens entre la famille Tohsaka et l'Église font que leur objectif sera d'aider Tokiomi à gagner. L'Église sait déjà que le Graal de Fuyuki n'est pas celui du Christ, mais quitte à laisser quelqu'un s'emparer d'une machine à exaucer des souhaits, autant que ce soit à quelqu'un de confiance comme un chrétien tel que Tokiomi.
Risei est fier des compétences et de la dévotion de son fils, mais ne réalise pas ce qu'il cache. Il pense que l'entraînement chez Tokiomi et la Guerre le sauveront de la dépression suite à la mort de la femme de Kirei quelques jours avant l'apparition de ses reiju. À 80 ans, Risei fait partie comme son fils de l'assemblée du Huitième Sacre, les inquisiteurs chasseurs de démons.